Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXK8

Nip7, 60S ribosome subunit biogenesis protein NIP7 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nip7Q9CXK8 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Nip7Q9CXK8 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms