Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM2

Cdca4, Cell division cycle-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca4Q9CWM2 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cdca4Q9CWM2 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cdca4Q9CWM2 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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