Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR4

Rpl17, 60S ribosomal protein L17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl17Q9CPR4 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Rpl17Q9CPR4 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Rpl17Q9CPR4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms