Protein–RNA interactions for Protein: Q99NI3

Gtf2ird2, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 936 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2ird2Q99NI3 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gtf2ird2Q99NI3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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Gtf2ird2Q99NI3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
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