Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Creb3l3Q91XE9 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms