Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr3Q8K296 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Mtmr3Q8K296 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Mtmr3Q8K296 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms