Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

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Length 685 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Lypd1-202ENSMUST00000159417 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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TwnkQ8CIW5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TwnkQ8CIW5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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