Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hpf1Q8CFE2 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms