Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9J3

Spef2, Sperm flagellar protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,734 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spef2Q8C9J3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Csdc2-201ENSMUST00000038757 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 AC125117.1-201ENSMUST00000228121 468 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Spef2Q8C9J3 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Ypel3-203ENSMUST00000106357 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Spef2Q8C9J3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms