Protein–RNA interactions for Protein: Q810M6

Liat1, Protein LIAT1, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Liat1Q810M6 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Nob1-201ENSMUST00000003946 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Liat1Q810M6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC154747.3-201ENSMUST00000224471 3470 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Rgs12-205ENSMUST00000114283 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm44241-201ENSMUST00000203230 1662 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Actn4-211ENSMUST00000217157 3530 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Liat1Q810M6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.1 ms