Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Sbno2Q7TNB8 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms