Protein–RNA interactions for Protein: Q6P8K3

BC061212, Predicted gene 7978, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC061212Q6P8K3 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
BC061212Q6P8K3 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Olfr812-202ENSMUST00000203571 1232 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Gpr4-201ENSMUST00000060225 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
BC061212Q6P8K3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms