Protein–RNA interactions for Protein: Q6DIC0

Smarca2, Probable global transcription activator SNF2L2, mousemouse

Predictions only

Length 1,577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca2Q6DIC0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ppih-203ENSMUST00000106318 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarca2Q6DIC0 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Cyp2t4-202ENSMUST00000164093 1512 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Neurl3-202ENSMUST00000188666 1206 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gab3-201ENSMUST00000037374 2153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rab11b-ps2-201ENSMUST00000178377 657 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm11210-201ENSMUST00000150203 422 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Olfr12-201ENSMUST00000081274 1121 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarca2Q6DIC0 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms