Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Q6DFW0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms