Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ralyl-206ENSMUST00000193117 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Pkp4Q68FH0 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
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