Protein–RNA interactions for Protein: Q68FE8

Znf280d, Zinc finger protein 280D, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf280dQ68FE8 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Znf280dQ68FE8 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Znf280dQ68FE8 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.7 ms