Protein–RNA interactions for Protein: Q65CL1

Ctnna3, Catenin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnna3Q65CL1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm13464-201ENSMUST00000119418 935 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ctnna3Q65CL1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ctnna3Q65CL1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52 ms