Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm36756-203ENSMUST00000223029 1166 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm15770-201ENSMUST00000117498 584 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tdrp-206ENSMUST00000210414 323 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
PtprdQ64487 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms