Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Nat8f4-202ENSMUST00000159755 1129 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Ldhb-201ENSMUST00000032373 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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Cln3Q61124 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cln3Q61124 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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