Protein–RNA interactions for Protein: Q5GIG6

Tnni3k, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3kQ5GIG6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tnni3kQ5GIG6 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tnni3kQ5GIG6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.9 ms