Protein–RNA interactions for Protein: Q45VN2

Defa20, Alpha-defensin 20, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa20Q45VN2 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
Defa20Q45VN2 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Dab2ip-207ENSMUST00000112992 6184 ntTSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Aspm-201ENSMUST00000053364 9867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Exd1-201ENSMUST00000060009 6042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Grip1-202ENSMUST00000077871 3720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tbc1d1-204ENSMUST00000121370 5419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Chd3-202ENSMUST00000108661 7261 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Defa20Q45VN2 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms