Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0I2

Prr7, Proline-rich protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr7Q3V0I2 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 AC159246.1-201ENSMUST00000214478 249 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm9519-201ENSMUST00000206108 1337 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm16178-201ENSMUST00000129408 677 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Prr7Q3V0I2 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms