Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mir1938-201ENSMUST00000158746 100 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm37917-201ENSMUST00000194711 392 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Rnpc3Q3UZ01 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms