Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW13

D130052B06Rik, RIKEN cDNA D130052B06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D130052B06RikQ3UW13 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Agrn-202ENSMUST00000105574 7193 ntTSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.84□□□□□ -0.83
D130052B06RikQ3UW13 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Etv3-205ENSMUST00000170036 5127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.83□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Plk4-203ENSMUST00000203295 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cad-203ENSMUST00000200953 6489 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Cep128-210ENSMUST00000141429 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Ncald-211ENSMUST00000168992 3538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
D130052B06RikQ3UW13 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms