Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHD6

Snx27, Sorting nexin-27, mousemouse

Predictions only

Length 539 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx27Q3UHD6 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx27Q3UHD6 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx27Q3UHD6 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms