Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDK1

Trafd1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trafd1Q3UDK1 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Trafd1Q3UDK1 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Trafd1Q3UDK1 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms