Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Kdm4dQ3U2K5 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Kdm4dQ3U2K5 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms