Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBL6

Tnfaip8l3, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 8-like protein 3, mousemouse

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Length 204 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Tnfaip8l3Q3TBL6 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tnfaip8l3Q3TBL6 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tnfaip8l3Q3TBL6 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms