Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXB8

Colec11, Collectin-11, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Colec11Q3SXB8 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Colec11Q3SXB8 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.9 ms