Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Shroom4Q1W617 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm26542-201ENSMUST00000180443 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 AC153845.2-201ENSMUST00000217535 673 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Shroom4Q1W617 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm2639-201ENSMUST00000156881 1297 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mrto4-ps1-201ENSMUST00000220565 721 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Lim2-201ENSMUST00000004732 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Shroom4Q1W617 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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Shroom4Q1W617 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Bin2-205ENSMUST00000182814 1901 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
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Shroom4Q1W617 6030498E09Rik-202ENSMUST00000168144 510 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Shroom4Q1W617 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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