Protein–RNA interactions for Protein: Q148B6

Spatc1, Speriolin, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spatc1Q148B6 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Spatc1Q148B6 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Spatc1Q148B6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
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