Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Atp2b3Q0VF55 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Atp2b3Q0VF55 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms