Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 C330022C24Rik-201ENSMUST00000190581 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rundc1Q0VDN7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rundc1Q0VDN7 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms