Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Gata4Q08369 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gata4Q08369 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms