Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Myo18a-202ENSMUST00000092884 5117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pcdhb16-201ENSMUST00000051442 5225 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slc29a2-201ENSMUST00000025826 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm16582-201ENSMUST00000159627 1930 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Lmf2-201ENSMUST00000023283 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slit2-216ENSMUST00000174313 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ahsg-201ENSMUST00000023583 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC9.82□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ppp1r16b-202ENSMUST00000052927 6685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Mapk4-201ENSMUST00000091851 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Zfp219-202ENSMUST00000166169 3017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Knop1-202ENSMUST00000063607 4884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Jmjd1c-211ENSMUST00000174408 8377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Jmjd1c-201ENSMUST00000051446 8382 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.84
NrepQ07475 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
NrepQ07475 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms