Protein–RNA interactions for Protein: Q04857

Col6a1, Collagen alpha-1(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a1Q04857 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Pigyl-202ENSMUST00000148088 676 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Col6a1Q04857 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 197.3 ms