Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scg2Q03517 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms