Protein–RNA interactions for Protein: Q02738

Gjb4, Gap junction beta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb4Q02738 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gjb4Q02738 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms