Protein–RNA interactions for Protein: Q01815

Cacna1c, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, mousemouse

Predictions only

Length 2,139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1cQ01815 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cacna1cQ01815 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Cacna1cQ01815 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms