Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Sf3a1-201ENSMUST00000002198 4920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Itga4Q00651 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Itga4Q00651 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms