Protein–RNA interactions for Protein: Q000W5

Gbp10, Guanylate-binding protein 10, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp10Q000W5 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbp10Q000W5 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Gbp10Q000W5 Vangl1-201ENSMUST00000029453 6531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pik3cd-205ENSMUST00000118704 4894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 1300017J02Rik-201ENSMUST00000035163 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Fam219a-202ENSMUST00000108050 3321 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Gbp10Q000W5 Ephb1-202ENSMUST00000085169 4101 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms