Protein–RNA interactions for Protein: P97350

Pkp1, Plakophilin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1P97350 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Pkp1P97350 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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