Protein–RNA interactions for Protein: P86449

Trim43c, Tripartite motif-containing protein 43C, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43cP86449 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim43cP86449 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim43cP86449 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms