Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad50P70388 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad50P70388 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Rad50P70388 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rad50P70388 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms