Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 4930478K11Rik-201ENSMUST00000181875 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pkn1P70268 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pkn1P70268 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pkn1P70268 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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