Protein–RNA interactions for Protein: P60469

Ppfia3, Liprin-alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia3P60469 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Smim1-201ENSMUST00000125533 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ppfia3P60469 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ppfia3P60469 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms