Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 AC125108.1-201ENSMUST00000218986 2330 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Dcst1-201ENSMUST00000070820 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
P58686 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P58686 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P58686 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
P58686 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P58686 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
P58686 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Hnrnph2-202ENSMUST00000059297 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Zfp467-206ENSMUST00000114561 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Dph2-201ENSMUST00000030265 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
P58686 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Pdgfra-205ENSMUST00000201711 4088 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
P58686 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.07□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms