Protein–RNA interactions for Protein: P50704

Defa6, Alpha-defensin 6/12, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa6P50704 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Arhgap11a-201ENSMUST00000102545 4958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Madd-203ENSMUST00000075269 5756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dnajc16-201ENSMUST00000038014 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Fnip2-203ENSMUST00000133154 7299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Runx1-201ENSMUST00000023673 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rgs7bp-201ENSMUST00000063551 7077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Speg-201ENSMUST00000087122 10801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Pax2-203ENSMUST00000174490 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.81□□□□□ -0.68
Defa6P50704 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms