Protein–RNA interactions for Protein: P50404

Sftpd, Pulmonary surfactant-associated protein D, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpdP50404 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Sgtb-201ENSMUST00000044385 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SftpdP50404 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SftpdP50404 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms