Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Apoc3-203ENSMUST00000121916 709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm15678-201ENSMUST00000117573 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Crip2-202ENSMUST00000196015 772 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PtpreP49446 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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